主要职能为：负责《畜牧法》和国务院《种畜禽管理条例》的宣传和贯彻落实；种畜禽生产经营环境的检测与监督管理；商品畜禽养殖准入与养殖场备案管理；畜产品质量监督检查；牧草品种质量监督管理；种畜禽性能测定；负责父母代种畜禽品种的鉴定、管理；负责畜牧业生产新技术的试验、示范、应用与推广；畜牧业生产的信息网络化建设等工作。